Переход с оклада на % оплату труда для работника приведёт к ..?

Приведет к бухгалтерским манипуляциям, в результате которых пострадает работник. Потому что начальник всегда найдет за что процент снять. А оклад- это жестко фиксированная сумма, это обязательная выплата, с нее ничего выкрутить не получится.