Какие санкции Литва может наложить на Россию?

Собсно, такие же, или почти такие же, как и прочие страны. Создать "чёрный список" из персон, въезд которым на территорию Литвы закрыт. Объявить "чёрный список" предприятий и организаций, иметь с которыми дело литовским гражданам и компаниям будет запрещено. Заморозить активы оных граждан и организаций, ежели эти активы оказались в литовской юрисдикции (вклады в банках, недвижимость, собственность и т. п.). Это не исчерпывающий список, у некоторых стран он даже и длиннее, но типовыми и самым первыми обычно становятся вот эти.

Если обратиться к конкретике, к уже объявленным санкциям, то они относятся как раз к первому варианту из перечисленных: будет обновлён "чёрный список" граждан России, которым будет закрыт доступ в Литву.