Почему человек может болеть, после записки о его здравии в церкви (см)?

Потому что здоровье - это прежде всего здоровье духовное. И если человек поступил неправильно, особенно по отношению к вам, а вы пошли и помолились за его "здравие", то Бог, даруя этому неразумному человеку здоровье души, соответственно будет его "учить", а значит и наказывать, чтобы тот через физические страдания пришёл к пониманию своих поступков.