Почему в Яндексе цвет шрифта одних ссылок синий а других фиолетовый?

Синие - ещё не посещённые ссылки. Фиолетовые - те, которые вы уже просматривали.

В языке разметки гипертекста HTML можно настроить стили отображения не только для различных элементов веб-страницы (таких, как ссылки), но и для, так сказать, подвидов и условий. Например, ссылка может иметь вид "по умолчанию", может иметь отдельный вид (например, цвет, гарнитура и кегль шрифта, подчёркивание и т.п.) для уже посещённых, может иметь отдельный вид для события "на эту ссылку навели курсор мыши" и т.д.