Есть ли программы, для удаления книг-двойников из электронной книжки?

Конечно, есть. Правда, эти программы запускаются на компьютере. Поэтому для начала нужно подключить электронную книгу к компьютеру.

Таких программ довольно много, и все их назвать невозможно. Поиск файлов-дубликатов может быть как по названию файлов, так и по их размеру, содержимому и так далее. Правда, многие из этих программ платные.

Назову только две распространённые программы, которыми пользуются многие. Это - Total Commander и Ccleaner. Они тоже могут искать файлы-дубликаты.

В первой из них нужно нажать на кнопку "Поиск файлов" и в появившемся одноимённом окне выбрать вкладку "Дополнительно", затем - поставить галочку "Поиск дубликатов", а далее - нажать кнопку "Начать поиск".

Есть одно неудобство - файлы-дубликаты ищутся на всём компьютере.

А вот в Ccleaner есть возможность выбора диска (раздела), и это гораздо удобнее.

После подключения электронной книги к компьютеру и запуска программы Ccleaner нужно выбрать и нажать "Сервис" и "Поиск файлов". Появится окно поиска файлов-дубликатов, в котором нужно поставить галочку на нужном устройстве (это будет электронная книга, а также - флеш-карта, если она есть в книге), а с дисков С и D галочки снять. Также обратить внимание на галочки параметров поиска (где-то поставить, где-то снять). После нажать кнопку "Начать поиск". Когда файлы-дубликаты будут найдены, нужно выделить галочками ненужные и нажать кнопку "Удалить выбранные". Файлы-дубликаты будут удалены.

P.S. В старых версиях Ccleaner функции поиска файлов может не оказаться.