На столе было много пригари и мы старательно протираль его.Надо ли ставить"," перед И?

Да, запятая ставится обязательно!

На столе было много пригари, и мы старательно протирали его.

Это сложное предложение, состоит из двух простых с грамматическими основами "было много", "мы протирали" соственно.

Между простыми предложениями в составе сложного ставится запятая!