Можно ли сказать, что основной вопрос поэмы "Двенадцать" связан не с проблемой противостояния старого и нового миров, а с судьбой человека в мире, который разрушен".

Смотря с какой стороны посмотреть. Можно написать нет, потому что разрушенный мир появился из-за противостояния старого и нового миров. Можно написать да, поскольку по другому уже не может быть. Можно вообще написать нейтральный каким-то образом объединив вот это все.