Как в HTML описывается заголовок первого уровня «Глава 3», на который можно будет ссылаться по имени «3»?

Можно так:
<A name="3"></A>
<H1>Глава 3</H1>

или так:
<A id="3"></A>
<H1>Глава 3</H1>

или так:
<H1 id="3">Глава 3</H1>