Кому принадлежат атомы? Или они ничьи?

Категория собственности - это ограниченная в применении категория. Не общефизическая категория. На атомы она так же не может распространяться, как, например, категория добра и зла, категории человеческого родства. Сравните столь же абсурдные вопросы: "Атомы добрые или злые? У атомов бывают мама и папа?"

Можно заявить о своем праве собственности на участок земли или на автомобиль (кстати, о праве собственности интересно говорится в произведении Льва Толстого "Холстомер"), но невозможно утвердить свое право собственности на каждый атом данного объекта. Потому что закон действует лишь там, где можно покарать за его нарушение. О том, в чем за нарушение покарать невозможно, нормальные люди законов не пишут, чтобы над ними не смеялись - как над людьми, так и над их законотворчеством. Неужели за перенесение комочков (не то что молекул и атомов в их составе!) земли ветром на чужой дачный участок Вы сможете потребовать штраф с соседа? Или пожалуетесь на мэра города за порчу металла на Вашей машине дождем (не приказал рассеять тучи)? Да даже за радиоактивные вещества, принесенные за несколько тысяч километров из Фукусимы в количестве, безвредном для здоровья, ничегошеньки Вы не сможете потребовать через суд!

Поэтому и говорят, что атомы никому не принадлежат.