Потому что оказались никому не нужны.
Зачем нужен был ИК-порт в телефонах начала 2000-х годов? Габариты "трубок" того времени уже не позволяли установить на корпус какой-либо стандартный разъем интерфейса. USB интерфейс и Bluetooth тогда еще не получили особенного распространения. Даже такая, как сейчас кажется, неотъемлемая функция мобильной связи, как интернет-подключение, тогда была в совершенно эмбриональной стадии. А IrDA был устоявшимся стандартом, позволявшим при наличии стандартного оборудования -- IrDA-адаптера, иногда уже встроенного в компьютер (многие ноутбуки) подключить телефон с поддержкой IrDA к компьютеру, а для соединения двух таких телефонов между собой не нужно было ничего. Сейчас телефон можно подключить к ПК через USB, можно синхронизироваться через "облако", можно по Bluetooth -- и скорость соединения во всех этих случаях будет гораздо выше, а телефон не нужно держать напротив приемника все время, пока идет передача данных.
автор вопроса выбрал этот ответ лучшим