Windows 10 удаляет файлы без спроса при обновлении - как избежать?

Переместите все нужные вам файлы с системного диска С на другие, у вас должно быть как минимум 2 диска. Для того чтобы восстановить файлы, которые были удалены, сделайте восстановление системы. Такая функция есть в настройках. Система перед обновлением обычно создает точку восстановления.

Параметры обновления можно настроить, либо вообще выключить, выключать не рекомендуют, потому что может от этого некорректно работать система и антивирус.