Стравится ли давление через вакуум насос?

Все зависит от вашего насоса. Если он сделан правильно, все клапана держат и прокладки герметичны, то травление все равно будет, но не слишком сильное и вакуум некоторое время будет держаться. Но если вакуум нужен на длительное время, то клапан от насоса должен быть перекрыт.

И второе, какой вакуум. Если небольшой, для "школьных опытов", то это одно дело, а если "космический" вакуум, для научных экспериментов и он достигается не простой воздушной "помпой", а уже масляными насосами, то такой вакуум удержать очень сложно. Там предусмотрены автоматические клапаны, которые герметизируют систему, при достижении нужного вакуума.