Как объяснить заказчику, что настойка на спирте, а не на спирту?

Если говорить о настойке, то более употребительно "на спирту". Но если, к примеру, сказать о двигателе, то тут уместнее будет "на спирте" (Этот двигатель работает на спирте). Правописание в обоих вариантах правильное.

И это не единственное подобное слово. Есть "на горбе" и "на горбу"; "в аэропорте" и "в аэропорту"; "в хлеве" и "в хлеву"; "на дубе" и "на дубу".

А в Вашем случае лучше будет следовать требованиям заказчика. Он дал правильные ключевые слова для статьи, которая будет размещена на сайте. Ведь если людей при поиске в интернете будет интересовать настойка, то они в запросе, конечно же, наберут "… на спирту", а не "… на спирте".