Каким образом построенный и заселенный дом оказывается самостроем?

Причин много. Как правило, это комплекс начиная от неточностей в документах до грубых нарушений норм и правил строительства. Правил застройки территории.

А иногда просто мошенническая схема, целью которой является получение дохода, а не решение социальных задач.

Нельзя сбрасывать со счетов меняющуюся законодательную систему. Начинали строительство с одними законодательными требованиями, а ввод в эксплуатацию осуществляют по другим требованиям.

Слабый уровень изыскательских и проектных работ, учитывая их дороговизну от таких работ часто отказываются, а в последствии они преподносят сюрпризы.

Судебная практика России показывает, что основным фактом признания объекта недвижимости самовольным строением является не целевое использование земельного участка, как пример, на землях СНТ построили многоквартирный дом, итог - суд и снос.