Путин не поздравил с Новым годом(2019) глав Грузии и Украины, почему?

Я, к сожалению, не в курсе, как на таком уровне по этикету положено поступать: поздравлять тех, кто к тебе относится с негативом или нет.

Но по человечески, конечно, понять можно, почему нет поздравлений главам этих стран. Они сами-то будут поздравлять президента РФ и его страну?

Нет, скорее всего. Так что все правильно.