Безусловно конспиративная квартира с начала 20 века стала называться так же(ниже напишу как) еще и квартирой, куда заговорщики-конспираторы должны были явиться по приглашению через какую-нибудь шифрованную записку или по уговору. Поэтому в просторечьи многие стали называть такую квартиру для сбора просто явкой. Ну а штаб - это все-таки место сбора руководителей чего бы то ни было. Штаб может быть военный, может быть и штаб заговорщиков ( т.е. главная явка), может быть и штаб осенне-полевых работ. Это уж как получится. Еще необходимо добавить, что явка - это чисто русское слово, придуманное примерно в годы первой русской революции 1905 года.
автор вопроса выбрал этот ответ лучшим