Откуда атомы в теле человека?

Да не миллион "по меньшей мере", а "по меньшей мере", миллиарды. А если учитывать циркуляцию вещества в течение жизни, то триллионы.

Откуда берутся - отовсюду вокруг, мы состоим из них, вбирая в себя вместе с едой, воздухом, водой.

Упрощенно говоря, растение, например, вобрало в себя корнями атомы в различном виде (различных соединений), далее его съел человек или животное, которое съел человек, далее эти атомы синтезируются в телах будущих родителей, ребенок растет в утробе матери, набирая массу, создаваясь из того, что скушала мать.

А когда живой организм умирает, то организм разлагается другими живыми организмами и в ходе различных химических реакций, на атомы и различные соединения атомов, а потом снова они синтезируются в какие-то организмы, растения и пр