Почему даже христиане азербайджанцы ненавидят армян, они же тоже христиане?

Многие азербайджанцы - нехристиане, а армяне - христиане.

Они ненавидят скорее всего из-за религии, либо из-за территорий, либо азербайджанцы считают армяне должны принадлежать азербайджанцам.

Так делать нельзя. Это грех.