Есть ли в сердце вакуум?

Я думаю, что нет.

Вакуум - пространство, свободное от вещества.

Т.е. если бы в сердце был вакуум или, как вы говорите, - отсек с вакуумом, то данный отсек моментально заполнился иной материей, содержащей атомы и молекулы, будь то кровь или кислород, поскольку они существуют в нашем мире и создают давление, которое как раз и направляется в место, свободное от вещества, чтобы его заполнить.