Может ли как-то навредить малышу аквариум, установленный в его комнате?

Аквариум хорошо.

Но есть три нюанса.

1. Корм для рыбок (особенно сухой) может быть аллергеном для ребенка - а детишка может либо его нажеваться (из интереса), либо просто вдыхать из воздуха - когда рыбок кормят сухим кормом, то его растирают пальцами и сыпят в аквариум, но пыль от него остается в воздухе.
2. Не нужно забывать, что аквариум - это не игрушка, это живой мир, биоценоз рыбок, водорослей, улиток и прочих обитателей. А любой биоценоз имеет свои продукты жизнедеятельности, которые тоже попадают в окружающий воздух и могут стать аллергенами. Да и вообще не советую держать аквариум в той комнате, где кто-то будет каждую ночь спать. Дышать нужно свежим воздухом.
3. Аквариум - вещь бьющаяся, поэтому для маленького ребенка несколько опасен.

С учетом этих нюансов я бы поставил аквариум в общей гостиной, где днем присутствуют все, то есть детишка под присмотром, а ночью никто там не спит и не вдыхает продукты жизнедеятельности биоценоза.