Законно ли составление двух протоколов по КоАП РФ в одно время, обосновать?

Данная ситуация вполне может иметь место и будет вполне законна и обоснованна. Приведу пару примеров из своей практики:

1. Лицом, в отношении которого возбуждено дело об административном правонарушении нарушены разные статьи КОАП РФ. Нарушен режим особо охраняемой территории (заповедника) - статья 8.39 КоАП РФ. При попытке оформления инспектором заповедника протокола, гражданин допустил действия, квалифицирующиеся по статье 20.1 КОАП РФ (мелкое хулиганство) - т.е. ругался нецензурно, порвал должностному лицу одежду. В связи с отсутствием документов, нарушитель доставлен инспекторами в отдел полиции, где на него подано заявление о мелком хулиганстве. После установления личности хулигана на него одновременно 2 должностными лицами оформлено 2 административных протокола - один инспектором заповедника (ст. 8.39), а второй - сотрудником полиции (ст. 20.1). Время составления протоколов поставлено одинаковое, но, разумеется, знакомился с ними нарушитель и подписывал по очереди. Вспоминается еще один аналогичный случай, когда у нарушитель режима заповедника нарушил одновременно ст. 20.8. КоАП - и в этом случае одновременно было оформлено 2 протокола 2-мя разными должностными лицами.
2. Второй довольно распространенный случай - когда протокол составляется в отсутствии нарушителя. Например, гражданин нарушил режим заповедника (скажем, проехал по запретной территории на автомобиле) и допустил неповиновение законному требованию должностного лица заповедника (причем даже не обязательно в это же время или день); вскоре нарушитель установлен и ему направлено и вручено извещение о вызове его для составления протоколов. Он не является, и в установленное время два разных должностных лица одновременно, составляют на него два разных протокола по двум статьям - 8.39 и 19.4 часть 1. Время составления протоколов будет одно.
3. В отношении юридического лица такое тоже возможно. Скажем, Росприроднадзор проводит проверку учреждения и выявляет ряд нарушений. Представитель учреждения вызывается для оформления протоколов в установленном порядке, но не является. Тогда все протоколы будут оформлены (нередко разными должностными лицами) с указанием одного и того же места и времени составления и направлены организации - нарушителю.