Какой источник выплат зарплат сотрудникам Роснефти и Газпрома?

Нет конечно. Это же не ФГУП. Сотрудники не являются госслужащими (ну может за исключением буквально нескольких приданных безопасников). Обычное АО, со своей бухгалтерией, затратами на з/п, дивидендами и прочим.