Можно ли анонимно пожаловаться в трудовую комиссию на работодателя?

В трудовую инспекцию нельзя. Трудовая инспекция может не раскрывать автора жалобы. Но если вопрос касается персонально вас, то как могут разбирать, не называя автора жалобы? А если вы имели ввиду трудовую комиссию в вашем профсоюзе, то здесь вам придётся обращаться лично.