Откуда взялся «первичный материал», который поучаствовал в Большом Взрыве?

А физика не знает ответа на данный вопрос. Так как до момента Большого взрыва не существовало известной нам физики, а была какая-то другая физика, которую еще не открыли.

Так что можно придумывать любой вариант, который вам нравится. Фантасты уже много идей предложили:

• что взорвалась наша вселенная, которая сжалась обратно в точку. Есть версия, что при сжатии время шло наоборот и все циклы повторяются.
• что произошел взрыв атома другой, более большой вселенной.
• что произошло разделение вселенной и антивселенной (чтоб объяснить куда делось антивещество)
• что окружающего мира вообще не существует и это коллективная галлюцинация
• что взрыв был вызван сверхсуществом, которое проводит эксперимент
• что взрыв произошел из-за заброса машиной времени избытка материи из будущего в прошлое

ну и т.д.