
Как пишется: войдешь или вайдешь? Почему?

При написании глагола из вопроса, безусловно, могут возникнуть сомнения.
В данном глаголе два слога. Ударным является второй, поэтому правописание в нем гласной сомнения вызвать не должно. Сомнение может вызвать необходимость постановки мягкого знака на конце слова после шипящей буквы ш.
Вспомним правило, регулирующее постановку постановку мягкого знака на конце слов после шипящих в глаголах. В нашем случае это форма изъявительного наклонения будущего времени второго лица единственного числа ( ты что сделаешь? ). В этой форме мягкий знак на конце необходим.
Первый слог является безударным, в нем можно написать о или а. Выбор гласной объясняется тем, что она находится в морфеме, являющейся приставкой.
В русском языке нет префикса ва-, есть только приставка во-.
Правильный вариант войдешь.