Одна из катушек зажигания может работать с перебоями?

Вы в своём вопросе уже дали ответ, тем более, что перестановка катушки зажигания на другой цилиндр показала неисправность конкретной катушки. К сожалению ремонт дефектной катушки зажигания, несмотря на казалось бы внешне дефектов не видно, невозможен. Причина неисправности возможна любая, несоблюдение технологии при изготовлении, межвитковые замыкания в катушке, микротрещина в корпусе, катушка установлена не комплектная и так далее. В вашем случае следует заменить неисправную катушку зажигания. Специалисты рекомендуют производить замену всех катушек сразу комплектом на все цилиндры (так должны продаваться), поскольку в комплекте катушки имеют одинаковые электрические характеристики.