Кто его знает. Как сказать иначе? Какие есть синонимы?

К подобному выражению можно подобрать достаточно много синонимов...

Довольно часто слово "кто" народ заменяет на такие слова, как - "бог" "хрен", "пёс, "чёрт", "шут" и другие менее благозвучные... Нередко слышу такое выражение: "Леший его знает"!

Можно немного переиначит и сказать: "Одному Богу известно" (или "Аллаху", кто как, в зависимости от вероисповедания).

А можно сказать и просто: "Неизвестно" или "Будущее покажет"!

Хотя лично больше всего нравится, как поговаривал мой дедушка: "Об этом история умалчивает".