Как заменить трансформатор в микроволновке?

Я думаю не возможно. Если только поставить ещё второй трансформатор и будет два трансформатора вместо одного.

И при обязательном условии, если на вашем трансформаторе будет высоковольтная обмотка, а накальный можно поставить отдельно.

Напряжение накала и ток не велики, такой трансформатор будет не больших размеров, места для него там предостаточно.

Схема БП микроволновки для наглядности: