С позволения сказать выделяется запятыми или нет?

Это словосочетание вводное, поэтому его с обеих сторон нужно выделять запятыми. Если же оно находится в начале или в конце предложения, тогда запятая нужна только одна: в первом случае после, а во втором - перед словосочетанием.

Этот, с позволения сказать, товарищ, задумал нас обмануть, но мы вовремя раскусили его. С позволения сказать, нехорошую вы себе взяли привычку - опаздывать каждый день. Придётся теперь подтянуть пояса тем, кто не помышлял о диетах, с позволения сказать.

Такое вводное словосочетание часто используется, когда автор предложения хочет показать себя сдержанным и воспитанным, высказывая своё неудовольствие чем-либо.