Почему некоторые номера телефонов трехзначные?

Есть два равнозначных объяснения, и для каждого частного случая одно из них будет правильным.

В первом случае телефонная сеть маленькая (например телефонная сеть крупного или среднего предприятия) и ей хватает нескольких сотен номеров, отсюда и всего три цифры (знака) в номере. Во втором случае (сотовые сети) часть номера просто не набирается (для того, чтобы в этом убедиться посмотрите короткие номера сотовых операторов - рядом с коротким номером сети имеется его полный вариант для сетей других операторов), но программным обеспечением базовой станции сотового оператора этот не полностью набранный номер (последние четыре цифры) определяется согласно списку коротких номеров как полный.