Какие намеки кашлем и шмыганьем вы встречали?

Чаще всего это встречается как манипуляция и как некая договоренность, которая начинает действовать не предварительно, а в самом ходе разговора, в котором участвуют больше, чем 2 человек.

Тогда "кашель" такого рода можно трактовать как сигнал к тому, что нужно действовать по другому, как предупреждение, например о том, что сейчас можно выдать нежелательную информацию и следует быть осторожней.

Или "хмыканье" может звучать как прекращение какого-то действия и привлечение внимания к себе, например педагог, который зашел в аудиторию, призывает таким образом к тишине и вниманию в себе студентов, которые до этого шумели.