Почему в октябре 1993 года,войска были за Ельцина?

Потому что в руках ЕБН были финансы. Танковым экипажам, стрелявшим по зданию ВС, хорошо заплатили - по 1000 долларов на человека, что по тем временам равнялось полугодовой зарплате. Что касается сидельцев в ВС, то не стоит думать, что они были чем-то лучше Ельцина - при других раскладах уже они бы платили танкистам за стрельбу по "кровавому диктатору". Короче говоря, что ЕБН, что его оппоненты были продуктами метаболизма всё той же КПСС, поэтому оказались вполне достойны друг друга.