Стратификация или стратефикация — как правильно?

Стратификация это слово не является сложным и поэтому буква «и» в этом слове не является соединительной гласной для двух основ( такими буквами может быть о или е).

Слова «фикация» в русском языке нет, поэтому правильно писать:

Стратификация.

Подобные слова мистификация, электрификация, газификация.