Жемчужина считается: яйцом, икринкой или коконом устрицы?

Ничего подобного. В морскую ракушку жемчужницу или другую, речную ракушку(устрицу), попадает песчинка и она обрастает перламутром, так и появляется жемчужина. Это инородное тело, она просто растёт в ракушке, пока мы её не возьмём.