Почему героями аниме становятся чаще всего подростки?

Потому что большая часть аниме относится к жанрам седзё и сёнен - то есть их целевая аудитория - подростки. Соответственно и главные герои в них такие, чтобы зрители могли им сопереживать и с большей вероятностью ассоциировали себя с ними.

В других жанрах встречается такой приём как противопоставление "наивный ребёнок - жестокая реальность", чтобы ярче показать сюжет и больше эмоций вызвать у зрителя. Как, например, было в аниме "Созданный в бездне" - всё началось как странноватая детская сказка, а потом становилось всё мрачнее и мрачнее. Жанр сейнен намекает тем, кто знает, что это, что ничего хорошего героев не ждёт, каким бы мягким не казалось начало.