Почему слова йод и йогурт не пишутся через букву ё?

Потому что это слова, заимствованные из других языков. В письменном виде иногда достаточно сложно отразить фонетические особенности слов подобного рода.

Просто для примера, почему-то все называют известный бренд Huawei "Хуавэй", хотя единственно правильно произносить Вавэй. То же самое с автомобилем Ламборгини, Самсоном (Samsung), Зироксом (Xerox) и т.п. Ну и Лубутаном, куда же без него?