Почему в этом предложении ставится запятая: "Примечателен факт, что в экземпляр этот принадлежал великому художнику"?

Перед словом что всегда ставится запятая только если это не начало предложения

Потому что "что" разделяет части сложного предложения. Грамматически основы: "примечателен факт; экземпляр принадлежал".